水利工程档案管理的工作是水利基本建设工作的重要组成部分，也是落实工程质量终身制的重要凭证，必须纳入项目管理工作的全过程，按照统一领导、分级管理的原则设立相应机构或配备专人做好档案管理工作，项目法人负总责，其他参建单位各负其责。
水利工程档案产生于整个水利基本建设全过程，包括从项目提出、可行性研究、设计、决策、招（投）标、施工、质检、监理到竣工验收、试运行（使用）等过程中形成的，应当归档保存的文字、图纸、图表、声像、计算材料等不同形式与载体的各种历史记录。
水利工程档案工作的进程要与工程建设进程同步。即所有基本建设项目，从立项时，就应开始进行文件材料的收集、积累和整理；签订勘测、设计、施工、监理等协议（合同）时，要对水利工程档案（包括竣工图）的质量、份数和移交工作提出明确要求；检查工程进度与施工质量时，要同时检查工程档案的收集、整理情况；进行单元与分部工程质量等级评定和工程验收（包括单位工程与阶段和竣工验收）时，要同时验收应归档文件材料的完整程度与整理质量；并在验收后，及时整理归档。整个项目的归档工作，应在竣工验收后三个月内完成（项目尾工的归档，应在尾工完成后的一个月内完成）。
水利工程档案必须完整、准确、系统，并做到字迹清楚、图面整洁、装订整齐、签字手续完备，**、**等还要附以有关情况说明，所有归档材料不得使用园珠笔、铅笔和红墨水等易褪色材料书写（包括拟写、修改、补充、注释或签名）。
工程档案由各参建单位汇总、整理后交监理单位审查，经审查合格后的案卷再向项目法人和工程管理单位移交。水利工程档案的竣工验收，应在竣工验收委员会（工作组）的领导下，与工程（项目）验收同步或提前进行。
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