上机作业2:利用chemsketch及chemoffice建立化学文档。
2.1 利用chemsketch或chemdraw给出下列脱氢松香作为n 取代基,合成了新型n 取代马来酰亚胺耐热改性剂的合成路线。
提示:用chemsketch绘制时可使用五元环及苯环的模板;文字部分可切换至draw模式下进行输入;abc工具栏内有常用基团缩写可供选择;
2.2 利用chemsketch先给出生物碱(alkaloids)当中的管箭毒碱(tubocuraran)的结构式(二维),并完成以下操作:
1) 对分子中的原子进行重新编号;并将其中具有芳香性的部位标示出来(提示:使用工具菜单中选项);
2) 给出该分子的分子式、分子量、组成百分比、表面张力、密度的信息(提示:使用工具菜单中选项);
3) 将其转化为三维结构式,并对此结构进行优化,然后以球棒模型表示;
4) 分别给出两个氧原子o(25)与c(24)和c(26)和o(1)与c(2)和c(12)所成的夹角度数以及键长,以及两个氮原子n(17)与c(18)和c(19)和n(5)与c(4)和c(6)所成的夹角度数以及键长。(所给原子序号均为重新编号后的值);
5) 对该分子进行自动旋转并改变显示方式的操作,观察其空间构型。请将绘制得到的结构图及相关信息以word文档形式给出。
2.3利用chem3d对下列化合物完成以下操作:
1)以球棍模型”ball &stick”形式给出该化合物的三维结构;
2)对该结构进行能量最小化计算(mm2 /minimize energy),给出计算后的三维结构,要求显示出元素名称和编号,并且给出对应的键长、键角和二面角数值;
3)计算该化合物的空间位阻能(mm2 /computer properties)和分子体积(analyze/ computer properties/connoly solvent-excluded volume),给出计算结果。
2.4请依照如下两图利用chemsketch绘制一蒸馏装置及一合成反应装置:(提示:使用模板工具栏中的lab kit 选项。
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