一、dna的一级结构——碱基序列。
dna的一级结构即是指四种核苷酸(damp、dcmp、dgmp、dtmp)按照一定的排列顺序,通过磷酸二酯键连接形成的多核苷酸,由于核苷酸之间的差异仅仅是碱基的不同,故又可称为碱基顺序。
要点】:1、dna中的碱基排列顺序构成了dna的一级结构。
2、核苷酸之间的连接方式是:一个核苷酸的5′位磷酸与下一位核苷酸的3′-oh形成3′,5′磷酸二酯键,构成不分支的线性大分子。
3、dna分子具有严格的方向性。5′末端为游离磷酸基,3′末端为游离羟基(-oh)。
二、dna的二级结构——双螺旋结构。
1、双螺旋结构模型。
1)dna是反向平行的互补双链结构。
①两条脱氧核苷酸链反向平行,一股链是5′→3′走向,另一股链是3′→5′走向。
②脱氧核糖和磷酸通过磷酸二酯键交替连接位于双链外侧,形成dna分子骨架。
碱基通过碱基互补配对形成氢键,排列在内侧。
2)dna双链是右手螺旋结构。
螺旋直径:2nm
螺距:3.4nm
螺旋一周包含:10对碱基。
每对碱基旋转角度:36°
每对碱基平面距离:0.34nm
两股链之间在空间上形成一条大沟和一条小沟,这是蛋白质识别dna的碱基序列,与其发生相互作用的基础。
3)疏水力和氢键维系dna双螺旋结构的稳定。
横向靠氢键,纵向靠碱基平面间的疏水堆积水。从总能量意义上讲,碱基堆积力对于双螺旋结构的稳定性更重要。
沃森和克里克提出的dna双螺旋结构属于b型双螺旋。它是以生理盐溶液中抽出的dna纤维在92%相对湿度下进行x-射线衍射图谱分析而获得。改变溶液的离子强度或相对湿度时,dna双螺旋结构的沟深浅、螺距、旋转角都会发生改变,形成不同构型的dna。
常见的有b型、a型、z型等。
总之,dna的双螺旋结构永远处于动态平衡中。
三、dna的**结构:
双螺旋dna进一步扭曲盘绕则形成其**结构,超螺旋是dna**结构的主要形式。
超螺旋结构。
1、超螺旋:将dna的两端固定,使之旋进过分或旋进不足,dna双链上就会产生额外的张力而发生扭曲,以抵消张力。这种扭曲称为dna双链的超螺旋结构。
正超螺旋:旋进过分的方向与dna双链的螺旋方向相同
负超螺旋:旋进过分的方向与dna双链的螺旋方向相反。
研究发现,所有的dna超螺旋都是由dna拓扑异构酶产生的(《生物化学与分子生物学》)。
一)原核生物和线粒体dna是环状dna结构。
原核生物dna和线粒体dna(mtdna)都是闭合环状的双螺旋结构,这种双螺旋环状分子再度螺旋化成为超螺旋结构。
二)真核生物。
染色体同样具有超螺旋结构。
真核生物虽然其染色体多为线形分子,但其dna均与蛋白质相结合,两个结合点之间的dna形成一个突环结构,类似于共价封闭环分子,同样具有超螺旋形式。真核生物中,dna与组蛋白八聚体形成核小体结构时,存在着负超螺旋(《生物化学与分子生物学》)。
DNA的结构
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