DNA的高级结构

发布 2020-01-02 02:07:28 阅读 6579

(三)dna的高级结构:

1) 2023年watson与crick提出的dna双螺旋结构模型,主要有三方面依据:

1. 核酸化学结构和核苷酸键长和键角数据。

2. dna x-射线衍射分析。

3. dna碱基组成的chargaff规则;同一物种不同组织和器官,dna碱基组成具有生物种特异性。且摩尔数为a=t, g=c, a+c=g+t。

2) dna二级结构:

w-c dna分子双螺旋结构模型见p480 图13-5,要点如下:

1. 两条反向平向的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕,两条链均为右手螺旋。

2. 碱基位于双螺旋内侧,核酸与核糖在外侧,彼此通过3‘,5‘-磷酸二酯键相连接,形成dna分子骨架。碱基平面与纵轴重直,糖环平面与纵轴平行。

多核苷酸链方向3‘→5‘为正向(p487 图13-6),形成一条大沟和一条小沟。

3. 双螺旋平均直径为2nm,两个相邻碱基对之间相距高度为0.34nm,两核苷酸之间夹角为360,沿中心轴每旋转一周有10个核苷酸,每一转的高度(螺距)为3.4nm。

4. 两条链被碱基之间形成的氢键连成一体,互相匹配,a与t配对,形成两个氢键,g与c配对,形成三个氢键。

5. 碱基在一条链上的排列顺序不受任何限制,一条链序列确定后则决定另一条互补链序列。遗传信息由碱基序列所携带。

dna结构可受环境影响而改变,有a、b、c、d、e和z型等不同构象存在。

a、 b型是dna基本构象,e型为左手双螺旋。

b型:为w-c双螺旋结构,dna钠盐在较高湿度下(92%)制得的纤维结构。

a型:螺体较宽而短,rna分子双螺旋区以及rna-dna杂交双链具有与a-dna相似结构。

p489 表13-6 a、b和z型dna的比较。

dna二级结构主要是形成双螺旋,但在某些情况下也能形成三股螺旋,第三股的碱基可与w-c碱基对中嘌呤碱形成配对。p489 图13-10三股螺旋dna碱基配对。

h-dna是通过分子内折叠形成的三股螺旋(p490 图13-11 h-dna结构),它存在于基因调控区,因而有重要生物学意义。

3) dna**结构:

dna**结构指dna分子(双螺旋),通过扭曲和折叠形成的特定构象,包括不同二级结构单元间的相互作用,单链与二级结构单元间的相互作用以及dna的拓扑特征。

超螺旋是dna**结构的一种形式,是双螺旋的螺旋。

将环状dna分子再额外多转几圈或少转几圈,都会使双螺旋中存在张力,为抵消张力,环状dna分子的轴再曲绕而形成超螺旋,左旋为负,右旋为正。

dan分子十分巨大,要组装到有限的空间,压缩比达1000-2000,组装成染色体则高达8000-10000(p492表13-7)。为此绝大多数dna以超螺旋形式存在,把很长的dna压缩成很小的体积内。如人类第一号染色体dna长7.

2cm,经弯曲缠绕后只有近10μm(压缩约7700倍)。

由于dna双螺旋为右旋,负超螺旋(左旋)有利于双螺旋解旋,自然界存在的环状dna几乎全是负超螺旋。

dna复制、重组或转录时,必须解旋解链,暴露出dna结合位点,使各种调控蛋白发挥作用,随后再形成超螺旋,存在拓扑学问题。生物过程需负超螺旋程度不同,可通过dna拓扑异构来调节其功能。

环状dna的一些重要拓扑学性质:

拓扑学是数学的一个分支,研究物体变形后仍保留下的结构特性。)

1. 连环数l:

为一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕次数,为一个整数。

l值不同,则为拓扑异构。

2. 扭转数t:

指dna分子中的watson-crick螺旋数。天然dnat变化不大,变化时有张力。

3. 超螺旋数w:

为超螺旋的超绕数,右旋为正,左旋为负。

l、t、w三者关系:

l=t+w l为整数,t、w可带小数。

4. 比连环差λ:

表示超螺旋程度。

=l-l0/l0 l0为松弛环形dna(无超螺旋)的l值。

p491 图13-12 环状dna不同构象:

a:线型dna。

b:环状dna,松弛型dna,l=25,t=25,w=0。

c:解链环状:拧松两周后,可形成两种环状dna,一种即为解链环状l=23,t=23,w=0 有张力;另一种为超螺旋dna,为d。

d:负超螺旋:形成超螺旋(左旋)消除解链影响,在力能学上有利,为自发过程,l=23,t=25,w=-2。

dna拓扑异构:除连环数不同外(如上述l=25,l=23),其他性质均相同的dna分子。

双螺旋dna在拓扑异构变化中t相同,是w不同导致l不同。

dna拓扑异构现象:为dna超螺旋状态与解旋状态之间的相互转换,不发生碱基组成或顺序(一级结构)的任何变化,是dna复制、重组或转录时所必需的。

拓扑异构酶:引起dna拓扑异构之间转变的酶,可改变dna拓扑异构体的l值,有两类:

类:使双链超螺旋dna转变成松弛型环状dna,每一次催化作用可消除一个负超螺旋,l值增加1。

类:使松弛型环状dna转变成负超螺旋型dna,每次催化作用使l减少2,又称促旋酶。

两类酶含量严格控制,使细胞内dna保持一定超螺旋水平。

2) dna与蛋白质复合物的结构(四级结构)

病毒、细菌拟核和真核生物的染色体都存在dna的组装和一定程度的压缩。核小体是真生物染色质的基本结构单位,由核小体链形成纤维,进而折叠螺旋化,组装成不同层次结构的染色质和染色体。

病毒:通常只有几个至几十个基因,主要由核酸和蛋白质组成,有时还含有脂质和糖类。病毒的侵染性由核酸决定。核酸位于内部,蛋白质包裹着核酸为衣壳,有的还有脂蛋白被膜。

由宿主不同,病毒分为噬菌体(宿主细菌与放线菌),植物病毒和动物病毒。动物病毒含dna或含rna,有的还有被膜,如流感病毒(冠状病毒),表面有许多突起,见p494图13-14,流感病毒为rna病毒。

二) rna的高级结构:

rna通常是单链线型分子,但可自身回折形成局部双螺旋(二级结构),进而折叠(**结构),除trna外,几乎全部细胞中的rna都与蛋白质形成核蛋白复合物(四级结构)。rna病毒是具有感染性的rna复合物。

1) trna的高级结构:

二级结构都是呈三叶草形,p496 图13-18,双螺旋区构成叶柄,另外有几个突环区。

1. 氨基酸臂:3‘-末端cca,可接受活化的氨基酸。

2. 二氢尿嘧啶环:有两个dhu。

3. 反密码环:环中部为反密码子,由3个碱基组成,次黄嘌呤核苷酸常出现于反密码子中,反密码子可识别mrna的密码子。

4. 额外环:是trna分类重要指标。

5. tψc环:几乎所有trna在此环中都含有tψc,trna折叠形成**结构,呈倒l型。

2) rrna的高级结构:

核糖体是蛋白质合成的工厂,核糖体是一种核酶,催化肽键合成的是rrna。

所有生物核糖体都是有大小不同两个亚基组成,大小亚基分别由几种rrna和数十种蛋白质组成,见p498 表13-9。

DNA的结构

学习目标与要求 1 概述dna分子双螺旋结构的主要特点。2 阐明碱基互补配对原则。3 熟练掌握dna结构中相关的计算。课前预习环节 学生通过自学教材 相互讨论等形式自主完成。1 读书p59 解开dna结构之谜 了解科学家和他们的重大发现。20世纪30年代,1951年,1952年,1953年,2 dn...

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