我国运动医学起步于廿世纪50年代中期，2023年前苏联专家来华举办“医师督导班”、“体育卫生班”，为我国培养了第一批运动医学的专业人才，他们成为我国运动医学事业的拓荒者和奠基人，开创了新中国的运动医学事业。我国于2023年成立了国家体育总局体育科学研究所，2023年成立了现北京大学医学部运动医学研究所，2023年中国运动医学会成立，2023年9月22日中国运动医学会加入国际运动医学联合会。
在50年代中后期我国一些医学院校和体育院校开设了“运动保健学”课程，“文革”时期是我国运动医学事业的停滞阶段，“运动保健学”课程也被“三合一”(运动解剖学、运动生理学、运动保健学)的“运动生理卫生”课程所取代。文革后，百废俱兴，全国高等院校体育专业都开设了运动医学课程，并由体育院校编写了“运动医学”教材(2023年)。
80年代初，教育部对全国普通高等学校体育教育专业(本科)教学计划进行全面修定时，考虑到“运动医学”课程的主要任务是研究、解决在竞技体育领域中与运动训练、竞赛有关的医学问题，是为运动训练管理专业培养高水平教练员、运动员服务的，而体育教育专业主要是培养合格的中等学校体育师资，是属于培养群众体育、学校体育方面的高级体育人才。因此，根据专业教学计划在课程设置中，应紧密围绕培养目标的总体要求，在体育教育专业的教学计划中终止了“运动医学”课程，新设了“体育保健学”课程。
在这样的一个新的历史时期背景条件下，体育保健学这门新兴学科诞生了。同时，***学位委员会在学科设置中，也增设了“体育保健学”这门新的二级学科。
体育保健学与运动医学在历史上有着渊源的关系，学科上有着相似的体系，但它们各自研究的对象、内容与任务却又各有不同。简言之，体育保健学是属于群众体育研究的范畴，是为推动全民健身计划纲要的实施服务的，而运动医学是属于竞技体育研究的范畴是为落实奥运争光战略服务的。当然，任何一个学科也不会绝然孤立地存在，体育保健学与运动医学以及其它相关学科也都是相互交叉、渗透的。
随着xx年北京奥运会的申办成功，中等学校中传统体育运动项目的开展，高等学校高水平运动队的发展，学校竞技体育人才的培养，也自然会赋予体育保健学以更新的研究课题。
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